مقدار پروتئین قابل هضم در پودر ماهی معمولاً بیش از 90 درصد از کل پروتئین خام موجود در آن است. این مقدار می‌تواند بسته به کیفیت و نوع ماهی استفاده شده و فرآیند تولید کمی متفاوت باشد. به دلیل این قابلیت هضم بالا، پودر ماهی به عنوان یک منبع پروتئین بسیار مؤثر در جیره غذایی دام‌ها و آبزیان مورد استفاده قرار می‌گیرد و به بهبود رشد و بهره‌وری کمک می‌کند.
